Антикорупційні підрозділи
Центральні органи виконавчої влади, діяльність яких спрямовується і координується Кабінетом Міністрів України через Міністра інфраструктури
Державне агентство автомобільних доріг України
Державна служба морського та річкового транспорту України
Державна авіаційна служба України
Державна служба України з безпеки на транспорті
Державне агентство інфраструктурних проектів України
Підприємства, установи та організації, що належать до сфери управління Мінінфраструктури та акціонерних товариствах, функції з управління корпоративними правами щодо яких здійснює Міністерство
Державне підприємство «Бердянський морський торговельний порт»
Державне підприємство «Маріупольський морський торговельний порт»
Державне підприємство «Миколаївський морський торговельний порт»
Державне підприємство «Одеський морський торговельний порт»
Державне підприємство «Херсонський морський торговельний порт»
Державне підприємство «Ізмаїльський морський торговельний порт»
Державне підприємство «Білгород-Дністровський морський торговельний порт»
Державне підприємство «Ренійський морський торговельний порт»
Державне підприємство «Морський торговельний порт «Чорноморськ»
Державне підприємство «Морський торговельний порт «Южний»
Державне підприємство «Морський торговельний порт «Усть-Дунайськ»
Державне підприємство «Стивідорна компанія «Ольвія»
Державне підприємство водних шляхів «Укрводшлях»
Державне підприємство «Адміністрація морських портів України»
Державне підприємство «Адміністрація річкових портів»
Приватне акціонерне товариство «Українське Дунайське пароплавство»
Державне підприємство обслуговування повітряного руху України
Державне підприємство «Міжнародний аеропорт «Львів» імені Данила Галицького»
Державне підприємство «Дніпропетровський орган сертифікації з сертифікації залізничного транспорту»
Державне підприємство «Державний автотранспортний науково-дослідний і проектний інститут»