Основним завданням Управління є надання Міністру об'єктивних і незалежних висновків та рекомендацій щодо:

1) функціонування системи внутрішнього контролю, у тому числі процесів управління ризиками, та її удосконалення;

2) удосконалення системи управління;

3) запобігання фактам незаконного, неефективного та нерезультативного використання бюджетних коштів та інших активів;

4) запобігання виникненню помилок чи інших недоліків у діяльності Міністерства та підприємств галузі;

5) розвитку доброчесності через поступовий розвиток культури етичної поведінки, заснованої на дотриманні етичних цінностей.